紫外線**器作用是通過微生物體內的脫氧核糖核酸吸收紫外光線來完成。*大吸收值分別是在波長200nm和265nm，而不是人們通常認為的來自低壓燈的254nm。波長為200nm的紫外光，主要是被**脫氧核糖核酸的核糖和磷酸鹽所吸收。而波長為265nm的紫外線主要被核酸中的腺嘌呤，鳥嘌呤，胞核嘧啶和胸腺嘧啶（核糖核酸中的尿嘧啶）所吸收。在吸收紫外線輻射以后，胸腺嘧啶二聚物是*為常見的產物。這種產物是由兩個相鄰的胸腺嘧啶分子結合而形成的。紫外線**的原理就是在于，這些二聚物和另外一些光化產品可以阻**氧核糖核酸的復制和再繁殖，從而達到殺死細胞的目的。
另外對于脫氧核糖核酸和核糖核酸，紫外線能夠引起細胞內的蛋白質、酶和其他分子的光化學反應。蛋白質的吸收峰值大約在280nm左右，然而在蛋白質中的縮氨酸根則吸收240nm以下的紫外線。紫外線也對其他的不飽和生物分子有殺傷力，例如：輔酶、***和電子負載體。當然，紫外線對分子的影響，不僅僅作用于脫氧核糖核酸和核糖核酸，它對大一些的微生物也有顯著的作用，例如**類、原生動物和藻類。雖然紫外線不能像作用于脫氧核糖核酸一樣，刺穿這些較大的微生物，但是它還是能用破壞其他分子的方法達到**效果。
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